Yüksek lisans ve doktora programlarımızda Katıhal Fiziği, Atom ve Molekül Fiziği, Genel Fizik, Nükleer Fizik ve Yüksek Enerji ve Plazma Fiziği olmak üzere altı anabilim dalı yer almaktadır. Fizik bölümü ve Üniversitemiz Merkezi Araştırma Labaratuvarı bünyesindeki modern araştırma olanakları lisansüstü öğretiminde önemli destek sağlamaktadır.